ФНС начала проверки IT-компаний в 2026: как сохранить налоговые льготы и избежать доначислений

Запись вебинара + разбор реальных налоговых рисков IT-бизнеса

У IT - компаний резко выросла вероятность налоговой проверки в 2026 году.

ФНС усилила контроль за компаниями, которые применяют налоговые льготы, и теперь анализирует не только документы, но и реальную модель бизнеса.

Это означает, что формального соответствия больше недостаточно.

Запись вебинара

Что вы узнаете из видео:

• какие компании уже проверяют;
• где возникают доначисления;
• реальные кейсы.

Если вы используете налоговые льготы , работаете с СМЗ или планируете рост, вашей IT компании более 3 лет - рекомендуем посмотреть запись.

Почему ФНС начала активно проверять IT-компании

За последние годы IT-бизнес получил значительные налоговые льготы:

• пониженная ставка налога на прибыль (до 5%);
• сниженные страховые взносы;
• специальные режимы поддержки.

По официальным данным:

• в реестре отечественного ПО внесено более 5 тысячи программных решений;
• в реестре аккредитованных IT компаний более 7 тысяч;
• резидентами Сколково является более 4 тысяч компаний.

Нужно понимать, что налоговый контроль стал крайне результативным. Об этом отчиталось ведомство в отчете, опубликованном в феврале 2026:

• Количество выездных налоговых проверок организаций в 2025 году увеличилось по сравнению с 2024 годом на 13% в целом по РФ, на 27% в Москве, на 45% в Санкт-Петербурге.
• Результативность выездных проверок по РФ — 98%. Результативность проверок в Москве — 97%, в Санкт-Петербурге — 98% (сохранено на уровне 2024 года).
• Средняя сумма доначисленных налогов по итогам результативных проверок организаций составила: 94 млн руб. по РФ, что на 45% больше 2024 года; 119 млн руб. в Москве, на 19% больше 2024 года; 213 млн руб. в Санкт-Петербурге, на 64% больше 2024 года.
• Количество уточнённых налоговых деклараций (расчётов) с доплатами налога по итогам контрольно-аналитической работы ФНС — 272 731 единица, с общей суммой налоговых доначислений 214 893 860 000 рублей, то есть в среднем каждая «уточнёнка» стоила бизнесу не менее 787 тыс. рублей.

Из этих цифр тенденции очевидны:

• проверок становится больше;
• практически любая проверка = начисление. Происходит это потому, что ФНС лучше подготовлен к проверке и выходит уже с большим кол-вом данных, полученных в рамках предпроверочного анализа;
• IT сектор не проверяли 3 года так как у IT сектора действовал мораторий на налоговые проверки). Получается, что льготы применялись без контроля долгое время. В условиях необходимости пополнения бюджета это очевидный сектор, который будут активно проверять в 2026.

Вырос контроль за применением налоговых льгот и за сектором в целом.

ФНС сегодня анализирует:

• структуру бизнеса;
• работу с самозанятыми;
• признаки дробления;
• соответствие модели требованиям льгот.

Что реально проверяет налоговая

Главное изменение 2026 года:

ФНС проверяет не документы, а суть бизнеса.

На практике это означает:

• как распределена выручка;
• кто фактически выполняет работу;
• есть ли зависимость подрядчиков;
• соответствует ли модель заявленным льготам.

И именно здесь возникают основания для доначисления.

Какие IT-компании попадают в зону риска

По практике и текущим проверкам:

В зоне внимания ФНС:

• компании с выручкой от 100 млн ₽;
• аккредитованные IT-компании;
• резиденты Сколково;
• бизнес с несколькими юрлицами;
• бизнесы с самозанятыми.

Как ФНС проверяет IT-компании в 2026 году

Проверка начинается задолго до официального уведомления.

ФНС проводит предпроверочный анализ, используя:

• банковские данные;
• данные контрагентов;
• отчетность;
• данные онлайн-касс;
• сведения из реестров.

Этап 1. Предпроверочный анализ

На этом этапе налоговая:

• сопоставляет выручку и модель бизнеса;
• анализирует связи между компаниями;
• выявляет признаки дробления;
• оценивает работу с самозанятыми.

Уже на этом этапе формируется позиция по доначислениям.

Этап 2. Запрос документов

ФНС запрашивает:

• договоры с клиентами;
• договоры с разработчиками;
• акты и счета;
• структуру группы;
• внутренние документы.

Важно: проверяется не только наличие документов, но и их соответствие реальности.

Этап 3. Анализ фактической модели

Налоговая оценивает:

• кто реально выполняет работу;
• где создается ценность;
• как распределяется выручка;
• есть ли зависимость между юрлицами.

Этап 4. Доначисления

Если выявлены несоответствия: ФНС доначисляет налоги, пени и штрафы.

5 ключевых рисков IT-компаний в 2026

1. Потеря налоговых льгот

Если модель не соответствует требованиям — льготы снимаются.

2. Дробление бизнеса

Несколько юрлиц без экономической логики → риск доначислений.

3. Самозанятые

ФНС может переквалифицировать отношения в трудовые.

4. Разрыв между договорами и реальностью

Документы есть — но не отражают бизнес.

5. Непрозрачная структура выручки

Если невозможно объяснить модель - возникает риск.

Самая частая ошибка IT-компаний

“Мы уже применяем льготы — значит все в порядке”.

Это не так.

ФНС оценивает обоснованность применения льгот

Что делать IT-компании уже сейчас

Если вы:

• используете налоговые льготы;
• работаете с разработчиками (ИП / самозанятые);
• строите платформу или SaaS;
• планируете рост или инвестиции.

Важно заранее проверить:

• есть ли риск доначислений;
• соответствует ли модель требованиям;
• где слабые места.

Как мы работаем с налоговыми рисками IT-компаний

В Зарцын и партнеры мы проводим налоговый аудит IT-бизнеса.

В рамках работы:

• анализируем структуру бизнеса;
• проверяем применение льгот;
• оцениваем работу с разработчиками;
• выявляем признаки дробления;
• даем конкретные рекомендации.

Результат — понятная карта рисков и сценарий действий.

Когда нужен аудит

Аудит особенно актуален, если:

• компания применяет IT-льготы;
• есть несколько юрлиц;
• есть самозанятые;
• планируется сделка / инвестиции;
• есть рост бизнеса.

Почему важно действовать сейчас

Налоговый контроль усиливается:

• ФНС анализирует больше данных в том числе в автоматическом режиме;
• проверки становятся быстрее;
• в поле зрения попадает больше компаний;
• доначисления в том числе ведут к рискам личной уголовной ответственности собственников и руководителей бизнеса.

Это означает, что “позже” уже может быть поздно.

Получить оценку налоговых рисков

Если вы хотите понять:

• есть ли риск доначислений;
• корректно ли применяются льготы;
• что нужно изменить.

Оставьте заявку.

Материалы по налогам и юридической архитектуре IT-бизнеса

Если вам актуальны налоговые риски, проверки ФНС и сохранение льгот, рекомендуем дополнительно изучить:

Налоговые льготы IT-компаний в 2026 году

Как получить, сохранить и не потерять налоговые преференции.

Аккредитация IT-компании: требования и риски

Какие критерии проверяются и где компании чаще всего допускают ошибки.

Передача персональных данных внутри группы компаний

Как выстроить безопасную архитектуру и избежать претензий регуляторов.

Согласие на обработку персональных данных и маркетинговая воронка

Как не потерять конверсию и не получить штраф.

FAQ Частые вопросы о налоговых проверках IT-компаний

Проверяют ли сейчас IT-компании чаще?

Да. После отмены моратория проверки IT-компаний стали системной практикой, и количество проверок продолжает расти.

Если компания применяет льготы — это риск?

Сам факт применения льгот — не риск.
Риск возникает, если модель бизнеса не соответствует требованиям для их применения.

Проверяет ли ФНС самозанятых разработчиков?

Да. Один из ключевых фокусов проверок — переквалификация отношений с самозанятыми в трудовые.

Можно ли использовать несколько юрлиц?

Можно, если есть экономическая логика.
Если структуры используются только для снижения налогов — возникает риск дробления бизнеса.

Что проверяет ФНС в первую очередь?

Не документы, а фактическую модель бизнеса:

• как распределена выручка;
• кто выполняет работу;
• как устроена структура.

Можно ли подготовиться к проверке заранее?

Да. Большинство рисков можно выявить до проверки и скорректировать модель.

Когда нужен налоговый аудит IT-компании?

Если:

• применяются льготы;
• есть самозанятые;
• несколько юрлиц;
• планируется рост или инвестиции.